Ontstaansgeschiedenis
De dak- en thuislozen zelf hebben aan de wieg gestaan van het project tijdens de Dolle Dwaze Daklozen Dagen in 1997. Martien Schaaper van de Nationale Woningraad (voorloper van Aedes) was drijvende kracht achter dit congres. Tijdens het congres deed architect Friso ten Holt het voorstel om een werkgroep in te stellen waarin alle partijen, waaronder ook de dak- en thuislozen, zouden aangeven wat hun wensen zijn over de opvang van dak- en thuislozen. Daaruit ontstond een initiatiefgroep die een concept bedacht voor begeleid wonen in een nieuwbouwwijk. Ymere slaagde er als eerste in om op IJburg een plek te vinden voor de realisatie van het concept. Ymere is daarbij verantwoordelijk voor de ontwikkeling en beheer van het Martien Schaaperhuis. HVO-Querido staat na de oplevering in 2008 garant voor de begeleiding en zorg voor de bewoners van het huis.

Participatie met de buurt
Bij de totstandkoming van het project is veel geïnvesteerd in participatie en het creëren van draagvlak bij omwonenden. Er is een begeleidingsgroep opgericht die bestaat uit omwonenden en vertegenwoordigers van Ymere, HVO-Querido, de politie en de Dienst Maatschappelijke Ontwikkeling. Deze begeleidingsgroep heeft primair tot taak om contact te onderhouden met de buurt en eventuele klachten vroegtijdig te signaleren en verhelpen.
Om eventuele overlast voor de buurt te voorkomen worden aan de bewoners van het Martien Schaaperhuis duidelijke eisen gesteld. Ze moeten bepaalde basisvaardigheden hebben, zoals zelfverzorging, vermogen tot leren en sociale vaardigheden. Dan wordt het streven naar zelfstandig wonen op termijn een reële optie.